من الخدمات التي تقدمها إدارة حماية الصحة ومكافحة الأمراض الانتقالية البرنامج الوطني للتطعيمات وهو عبارة عن القيام بعملية المتابعة والتحديث الدوري لجدول التطعيمات للأطفال، وكذلك تطعيمات البالغين، مستهدفا بذلك عددا من الشرائح المختلفة.
خدمة التبليغ عن أمراض انتقالية
خدمة التبليغ عن مضاعفات التطعيم
خدمة تبليغ عن عدم وجود حالات مرضية محددة